EKB kõrgeim organ on liikmete üldkoosolek. EKB igapäevatööd juhib ja esindab juhatus. Juhatus määratakse ametisse liikmete üldkoosoleku poolt 3 aastaks. Praegune juhatus on ametis 2019.a. detsembrist:

Ott Sarapuu, juhatuse esimees, Proto Avastustehas
Aivar Sirelpuu, Alexela Kontserdimaja
Evelin Tsirk, Tallinna Strateegiakeskuse ettevõtlusteenistuse turismiosakond
Feliks Mägus, Nordic Hotel Forum
Helen Kalberg, Tartu linnavalitsus
Külli Karing, Via Hansa & Borealis DMC & PCO
Ave Lääne, Pärnu linnavalitsus
Anne Samlik, Estravel Baltcoming
Tendo Lindvest, Tallink Hotels

Juhatuse liikmetele 2021.a. töötasu ei maksta.